CONSULTORIA

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Do campo para o laboratório, do laboratório para o computador, do computador para o campo

A Genômica é reconhecida como parte da solução de muitos dos desafios do agronegócio. Entre suas aplicações mais evidentes estão o melhoramento e a gestão de recursos genéticos, o registro genealógico, a certificação de origem, a rastreabilidade, a certificação de composição racial e a defesa sanitária. Apesar de sua complexidade, a aplicação da Genômica pode ser resumida em sete passos bem definidos:

 

 

A gestão de projetos de aplicação da Genômica no ambiente empresarial ou institucional requer atenção especial com a observância de procedimentos operacionais padrão, revisão de processos, treinamento de técnicos e equipes, além da atualização tecnológica constante. Além disso, o entendimento da visão estratégica e operacional da atividade é imprescindível para que a genômica seja articulada aos anseios do cliente. Na fase de planejamento, a AgroPartners vai até o cliente, estuda sua infraestrutura, objetivos e expectativas, e propõe um delineamento de projeto factível e gerador de valor.

Dados genômicos são prata, dados não-genômicos são ouro. Graças aos grandes avanços tecnológicos recentes, a geração de dados genômicos tem se aproximado cada vez mais de um modelo de commodity. Portanto, o verdadeiro impacto da Genômica no Agronegócio surge com a transformação dos dados em informação. E isso depende da integração e associação da Genômica com dados não-genômicos, como os fenótipos, o pedigree e o histórico da população animal/vegetal estudada. A equipe da AgroPartners possui experiência na organização e na orientação de coleta de dados dessa natureza, e coloca essa experiência à disposição de seus clientes.

Qualquer tecido animal ou vegetal com celularidade abundante é um candidato potencial para obtenção de DNA. No entanto, alguns tecidos são estratégicos devido sua praticidade de coleta, facilidade de acondicionamento, conveniência para transporte e eficiência no processamento laboratorial. Nossa equipe oferece todo o suporte para que amostras biológicas adequadas saiam do campo, cheguem íntegras ao laboratório e resultem na extração de DNA em grande quantidade e alta qualidade.

Atualmente poucas aplicações da Genômica envolvem o uso da sequência completa do DNA. A maior parte delas é satisfeita através do uso de uma amostra de pontos distribuídos ao longo do genoma. Algumas aplicações demandam milhares de pontos. Outras utilizam apenas algumas dezenas. Naturalmente, a quantidade de pontos capturados possui uma relação crescente com o custo da tecnologia: quanto mais pontos, maior o custo. De forma breve, as tecnologias disponíveis no mercado para as diferentes densidades de pontos são:

(i) ensaios baseados em PCR para dezenas;

(ii) Genotype-by-Sequencing (GBS) para centenas ou até poucos milhares;

(iii) SNP Chips para muitos milhares; 

(iv) sequenciamento completo (next- e third-generation sequencing) para milhões de pontos.

A AgroPartners auxilia seus clientes na otimização de seus investimentos em tecnologias genômicas, buscando sempre a melhor relação custo-benefício para cada aplicação.

Os dados genômicos podem ser encarados como um bem permanente, pois sua vida útil se estende por décadas após sua geração. Além disso, a geração de dados genômicos é um investimento substancial. Assim, algo tão útil e de alto valor deve ser armazenado, protegido e gerenciado de forma eficiente e segura. Nós colocamos à disposição do cliente nossa experiência em gestão de grandes bancos de dados genômicos por meio de ferramentas modernas, elegantes e de fácil uso.

Na AgroPartners encaramos os dados genômicos como um padeiro ou confeiteiro entende a farinha. Por meio de técnicas de processamento diferentes, a mesma farinha pode ser transformada em massas, salgados, pães, biscoitos, bolos e outros itens. No entanto, para executá-las com maestria é necessário muita dedicação, experiência, criatividade e equipamentos adequados. Temos uma equipe técnica formada por pesquisadores altamente capacitados, que aplicam inteligência bioinformática na análise de dados genômicos utilizando computação de alto desempenho. Nosso portfólio de análises inclui (mas não se restringe a): associação fenótipo-genótipo para o desenvolvimento de marcadores úteis para seleção, análise de composição racial e ancestralidade, estimação de níveis de endogamia, avaliação genética, e caracterização de biodiversidade e de recursos genéticos.

Uma vez que informação é extraída dos dados genômicos, chega o momento de tomar decisões estratégicas. Oferecemos pleno suporte ao cliente na comunicação e uso de tal informação, esclarecendo em cada situação o que ela implica e quais seriam seus potenciais desdobramentos.

Pronto para usar a Genômica no seu negócio?

Com as exigências do mercado pecuário por animais de elevada eficiência para crescentes resultados dentro e fora da porteira a Agropartners tem sido um parceiro de fundamental importância para o êxito dos trabalhos de melhoramento genético da raça Senepol de forma institucional pelo PMGS e em especial ao nosso trabalho frente ao Senepol Santa Luzia.

Pedro Crosara
Presidente do CDT - ABCB Senepol

É motivo de grande satisfação desenvolver trabalhos de genômica com a equipe de cientistas da AgroPartners, que permitem a construção de soluções assertivas para o uso da genômica no programa de melhoramento genético. Equipe dinâmica e muito qualificada!

Thiago Romanos Benatti
R&D Specialist - Suzano

Na FuturaGene desenvolvemos tecnologias inovadoras, que exigem alto nível de conhecimento científico. Para maximizar o resultado de nossos projetos, estabelecemos parcerias com instituições, universidades e empresas no mundo inteiro, sempre procurando as melhores soluções. A AgroPartners é nossa parceira há anos e temos projetos já concluídos e outros em andamento. A equipe técnica é de altíssimo nível, sempre conduzindo os projetos com muito profissionalismo e gerando resultados de qualidade.

Rodrigo Neves Graça
Platform Head, Plant Breeding - FuturaGene
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